为抢抓粤港澳大湾区和深圳先行示范区“双区”建设重大历史机遇，落实健康中国国家战略的总体要求，深化深港合作内涵，提升深圳医疗卫生服务水平，促进大湾区医疗健康产业发展，深圳市人民政府、香港中文大学、香港中文大学（深圳）于 2019 年 1 月正式签订协议共同建设香港中文大学（深圳）医学院及其附属医院。

香港中文大学（深圳）医学院在原生命与健康科学学院（成立于2018年11月）基础上于2021年8月正式成立，是港中大（深圳）继经管学院、理工学院、人文社科学院、数据科学学院之后建立的第五所具有从本科至研究生培养体系的学院。加拿大健康科学院院士、世界权威的心脏外科麻醉专家、麻醉和围手术期循证医学研究专家郑仲煊教授任医学院创院院长。医学院以培养兼具国际视野和人文情怀的卓越医学创新人才为目标，借鉴香港中文大学医学院（成立于1981年，在最近的QS世界大学排名全球29位）国际一流的办学基础和教学经验，充分吸收国内外医学院的先进办学理念，积极探索深港融合的医学教育新模式，建立本、硕、博人才培养体系。医学院已开设临床医学、生物信息学、生物医学工程、药学和生物科学五个本科专业。学院亦开设生物科学哲学硕士-博士项目、生物医学工程哲学硕士-博士项目和生物信息学硕士项目。港中大教务会负责审批和监督学位课程，指导及管理授课和教学有关事宜，监管港中大（深圳）学位资格认证的水准。香港中文大学（深圳）毕业生获颁香港中文大学学位证书，其中临床医学专业毕业生获颁香港中文大学（深圳）医学学士学位及香港中文大学理学（临床医学）学士学位。医学院将专注于医学、生命与健康科学的教学、科研与创新，致力于成为国际知名的医学院，为学生提供视野宽阔的教育机会，开展具有全球影响力的跨学科研究，为医学、生命和健康科学的专业发展、社群发展提供卓越服务。医学院通过全球遴选公开招聘的方式汇聚一流师资，建立一支具有创新精神及中英双语教学能力的师资队伍。